Научное изучение запасов водных беспозвоночных в водоемах Западной Сибири и Урала и их рационального использования ведутся ежегодно. К работе подключены опытные специалисты профильной лаборатории института. Мониторинг сырьевой базы проходит в озерах юга Тюменской области, а также Новосибирской, Курганской, Челябинской, Омской областей.
С 2025 года лаборатория промысловых беспозвоночных расширила изучение гаммарид – на каждом озере проводились углубленные исследования их вертикального распределения подо льдом: у дна, в толще воды и у поверхности – это позволит точнее рассчитать сырьевую базу и составить прогноз рекомендованного объема вылова.
Кроме того, ученые филиала продолжают актуализировать существующий перечень промысловых озер Западной Сибири – для этого проводятся рекогносцировочные – «разведочные» съемки. Эти работы позволят в будущем увеличить число пригодных для промысла озер.
В 2025 году комплексные рыбохозяйственные исследования проведены по среднему течению Оби и ее притокам в границах Сургутского района Ханты – Мансийского АО – Югры. Научная экспедиция в составе специалистов лабораторий рыбохозяйственной экологии и аквакультуры работала на собственном судне филиала и охватила крупнейшие притоки Оби – реки Тромъеган, Лямин, Пим, протоки Юганская Обь, Лангепас, Сухой Полой, Тундрина. Комплексно на этой территории рыбохозяйственные исследования проведены впервые за последние несколько десятков лет.
Комплексная экспедиция в бассейне реки Юрибей на Ямале проведена Тюменским филиалом ГНЦ РФ "Всероссийский НИИ рыбного хозяйства и океанографии" впервые за последние годы. В ходе исследований в реке отмечено 15 видов рыб, принадлежащих 7 семействам. Ученые провели массовые промеры и биологический анализ выловленных особей, взяли ихтиологический материал для последующего генетического и ихтиопатологического анализа, а также определения в рыбе тяжелых металлов и нефтепродуктов.
Юрибей – одна из самых рыбных рек западной части полуострова Ямал, на всем протяжении используется рыбами для размножения, нагула и зимовки. Здесь обитают сибирская ряпушка, сиг-пыжьян, чир, омуль арктический, пелядь, сибирский хариус, навага. Богатство видового состава обусловлено многоводностью, обилием больших озер и комфортными условиями на мелководье.
Комплексный научный учёт подъёмных стад ценной промысловой ихтиофауны специалисты Тюменского филиала ГНЦ РФ "Всероссисйкий НИИ рыбного хозяйства и океанографии" (ВНИРО) в Северной Сосьве проводят ежегодно. Исследования длятся два месяца. В 2025 году специалисты провели контрольные ловы, выполнили биологический анализ более тысячи рыб и массовые промеры свыше семи тысяч особей. Динамика уловов в реке по сравнению с прошлым годом осталась прежней. Однако в этом сезоне специалисты зафиксировали в несколько раз больше нельмы, в основном – молоди.
Оценку анадромной миграции сиговых видов рыб в Обь-Иртышском бассейне специалисты рыбохозяйственной науки проводят ежегодно весной, после вскрытия тысяч мелких соров. Рыба в этот период устремляется на нагул из Обской губы в обширную пойменно-соровую систему Оби. Это движение называется «вонзь», что в переводе с хантыйского языка – «ход рыбы против течения». Первой начинает подъем пелядь, следом идут остальные сиговые, завершает ход налим.
Учёт стерляди в р. Иртыш в границах Тобольского, Вагайского и Уватского районов Тюменской области рыбохозяйственная наука проводит ежегодно, дважды за сезон.
Сибирская стерлядь широко распространена в Обь-Иртышском бассейне. Она образует несколько относительно обособленных стад. Наиболее многочисленные из них и имеющие промысловое значение обитают в среднем течении Оби и в нижнем и среднем течении Иртыша. Результаты ежегодных рыбохозяйственных исследований становтяся основой прогноза допустимого вылова этого ценного сибирского вида рыб.